Vi vet med säkerhet att det fanns åtminstone två levande djur ombord på Vasa: ett par katter. Förmodligen var de ombord för att hålla ner antalet råttor på skeppet. Detta vet vi om för att katterna olyckligtvis inte överlevde och deras skelett finns i vår kollektion. Skeletten visar att katterna inte var fullvuxna, men ändå större än vanliga huskatter. Dess storlek påminner mer om storleken på Norsk skogskatt.
Vi har också hittat kycklingben, inklusive skallen, vilket antyder att kycklingarna var hela, så det kan ha varit levande hönor ombord så att de kunde lägga ägg. Övriga ben som hittats visar märken på slakt, så de var proviant (saltad kött).